寡糖的健康益处，以可发酵碳水化合物为食的细菌会产生许多有益物质，包括短链脂肪酸 (SCFA) 和某些 B 族维生素。

SCFA 可能对结肠局部和身体其他部位都有很多好处。具体来说，丁酸盐可以保护结肠组织免受结肠癌和溃疡性结肠炎等疾病造成的损害。